荔枝和红毛丹的主要区别在于形状、食用方法、种类和口味。红毛丹壳有很多红色的绒毛结构；荔枝壳有很多坚硬的突起。荔枝皮可以随时食用；但红毛丹需要去掉保护膜。另外，与红毛丹相比，荔枝的味道更浓更甜。
荔枝和红毛丹最大的区别在于形状不同。荔枝是我国栽培了2000多年的乡土水果，荔枝的皮肤上有很多红色坚硬的突起，非常致密。红毛丹的原产地在马来西亚，其皮肤有许多天鹅绒般的结构，故名红毛丹。
吃法不同虽然荔枝和红毛丹都有硬壳，剥皮后可以看到壳下的白色果肉，但需要注意的是，荔枝的果肉可以在剥壳后直接吃，果核可以吐出来，但红毛丹的外皮上有一层保护膜，不能直接吃，需要剥掉。
种类不同荔枝和红毛丹在水果市场上基本相同，都是多汁、味甜的水果，但这两种果实的母株在生物学分类上属于截然不同的物种，荔枝树是无患子目无患子科荔枝属常绿乔木，红毛丹是无患子目无患子科韶子属常绿乔木。
口味不同虽然荔枝和红毛丹都是亚洲非常受欢迎的甜水果，但这两种水果的口味略有不同。剥皮后的荔枝果肉味道更浓更甜，而红毛丹的果肉相对较为贫瘠，其甜味要比荔枝更淡一些。
